《Journal Of Proteomics》雜志在中科院分區中是2區，在JCR分區中是Q2區。
中科院SCI期刊分區
中科院SCI期刊分區是由中國科學院國家科學圖書館制定的。將所有的期刊按照學科進行分類，以影響因子為標準平均分為四個等級。分區越靠前一般代表期刊質量越好，發文難度也越高。
2023年12月升級版
| Top期刊 | 綜述期刊 | 大類學科 | 小類學科 |
| 否 | 否 | 生物學 2區 |
BIOCHEMICAL RESEARCH METHODS
生化研究方法
2區
|
這表明《Journal Of Proteomics》雜志在生物學領域具有較高的學術水平和影響力，其發表的論文質量和數量均得到了學術界的廣泛認可。
期刊WOS(JCR)分區（2023-2024年最新版）
| 按JIF指標學科分區 | 收錄子集 | 分區 | 排名 | 百分位 |
| 學科：BIOCHEMICAL RESEARCH METHODS | SCIE | Q2 | 35 / 85 |
59.4% |
| 按JCI指標學科分區 | 收錄子集 | 分區 | 排名 | 百分位 |
| 學科：BIOCHEMICAL RESEARCH METHODS | SCIE | Q2 | 28 / 85 |
67.65% |
WOS(JCR)分區是由科睿唯安公司提出的一種新的期刊評價指標，分區越靠前一般代表期刊質量越好，發文難度也越高。這種分級體系有助于科研人員快速了解各個期刊的影響力和地位。JCR將所有期刊按照各個學科領域進行分類，然后以影響因子為標準平均分為四個等級：Q1、Q2、Q3和Q4區。這種設計使得科研人員可以更容易地進行跨學科比較。
這進一步證明了《Journal Of Proteomics》雜志在生化研究方法領域的卓越學術地位和影響力。
根據最新的數據，該雜志的CiteScore指數統計為7.1，SJR：0.742，SNIP：0.736，（學科類別：大類：Biochemistry, Genetics and Molecular Biology 小類：Biophysics，分區：Q1，學科類別：大類：Biochemistry, Genetics and Molecular Biology 小類：Biochemistry，分區：Q2）這表明該雜志在生化研究方法領域具有較高的學術影響力和引用率。
《Journal Of Proteomics》雜志創刊于2008年，由NETHERLANDS的Elsevier出版商出版。作為一本享有盛譽的學術期刊，它致力于及時、準確、全面地報道國內外BIOCHEMICAL RESEARCH METHODS生化研究方法工作者在該領域的科學研究、技術革新和學術動態。
該雜志的國際標準簡稱是J PROTEOMICS，其ISSN號為1874-3919（印刷版）和E-ISSN號為1876-7737（電子版），該雜志歡迎涉及生物學領域的原創理論、方法、技術和重要應用的稿件，并刊載了涉及生物學領域的相關欄目：綜述、論著、述評、論著摘要等。
- Synthetic Biology（CiteScore 4.5）
- Journal Of Receptors And Signal Transduction（CiteScore 6.6）
- Microbial Physiology（CiteScore 5.2）
- Mycology（CiteScore 9.1）
- Cells And Development（CiteScore 3.7）
- Plant Communications（CiteScore 15.7）
- Plant Ecology & Diversity（CiteScore 3.3）
- Journal Of Cotton Research（CiteScore 5.2）
- Cryptogamie Mycologie（CiteScore 3.7）
- Microbial Cell（CiteScore 6.4）
